Gaussian高斯进行量化计算时,好的输入文件对计算的影响非常大。以下为一种较为简便的结合ChemOffice创建高斯输入文件的方法,供参考。1.ChemDraw或ChemBioDraw中画好化合物结构,定义好立体构型。然后将结构copy到Chem3D或ChemBio3D中,然后选中整个分子,通过“Structure"菜单的“clean up”操作将化合物三维结构整理为教合理的结构,之后另存为mol文件。
2.用GaussView打开mol文件,检查各原子的成键情况及对称性,如是否断键、芳环是否为共振结构等、键长、空间结构和对称性等方面的准确性。
3.通过GaussView——view——stereochemistry检查各个原子的手性。
4.Clean之后,依然另存为*.mol文件。最后另存为gjf文件即可。
注:在输入文件中加入geom=connectivity可以保持苯环的共振结构。